283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0976 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
336 aa  687    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  52.22 
 
 
355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  45.27 
 
 
335 aa  293  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  47.2 
 
 
347 aa  291  8e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  44.62 
 
 
350 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  42.86 
 
 
365 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  42.86 
 
 
365 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  45.34 
 
 
366 aa  286  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  45.54 
 
 
346 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  41.27 
 
 
350 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.96 
 
 
340 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  40.95 
 
 
350 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  46.23 
 
 
341 aa  276  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  40.62 
 
 
353 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.54 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 
351 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.72 
 
 
334 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.72 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  41.64 
 
 
345 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.83 
 
 
334 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 
355 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  41.34 
 
 
346 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  40.18 
 
 
337 aa  252  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  40.69 
 
 
335 aa  251  1e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 
341 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 
349 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  37.54 
 
 
337 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  41.27 
 
 
341 aa  241  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
339 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  36.19 
 
 
348 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 
351 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 
337 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  39.49 
 
 
336 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
348 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 
351 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  41.21 
 
 
337 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.49 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  37.54 
 
 
326 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  36.45 
 
 
347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  37 
 
 
342 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 
336 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
347 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  39.37 
 
 
336 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 
352 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  37.06 
 
 
349 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  40 
 
 
337 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 
336 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 
337 aa  229  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 
352 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  39.88 
 
 
352 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  40.06 
 
 
338 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  35.8 
 
 
347 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 
353 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 
335 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
335 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  36.36 
 
 
338 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 
338 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
333 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.61 
 
 
334 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  36.42 
 
 
332 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  36.36 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  37.65 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  36.11 
 
 
332 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  36.1 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 
335 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 
349 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.85 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.85 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 
338 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  35.85 
 
 
351 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  39.8 
 
 
335 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
335 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.53 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.53 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  35.53 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.53 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  39.06 
 
 
335 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 
339 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 
335 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.85 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 
335 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  36.31 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.53 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  37.11 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  36.71 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  35.53 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>