137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0330 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  100 
 
 
335 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  69.68 
 
 
327 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  69.68 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  65.94 
 
 
327 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  66.04 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  54.35 
 
 
338 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  54.84 
 
 
327 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  53.11 
 
 
338 aa  358  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  55.16 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  52.58 
 
 
328 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  49.85 
 
 
330 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  51.89 
 
 
348 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  51.89 
 
 
358 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  52.52 
 
 
327 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  52.52 
 
 
327 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  52.52 
 
 
327 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  51.56 
 
 
330 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  52.2 
 
 
327 aa  345  8.999999999999999e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  50.45 
 
 
330 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  52.52 
 
 
327 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  51.89 
 
 
327 aa  343  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  52.2 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  52.2 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  51.89 
 
 
327 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  51.94 
 
 
327 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  51.94 
 
 
327 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  51.94 
 
 
327 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  51.94 
 
 
327 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  51.29 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  51.13 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  50 
 
 
342 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  55.19 
 
 
332 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  50.65 
 
 
338 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  49.68 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  50.65 
 
 
334 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  46.27 
 
 
332 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  48.7 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  48.38 
 
 
334 aa  305  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  48.54 
 
 
334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  41.87 
 
 
337 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  40.27 
 
 
338 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.47 
 
 
325 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  34.93 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.86 
 
 
325 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.94 
 
 
325 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.4 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.96 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.38 
 
 
367 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.87 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.94 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.48 
 
 
386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.14 
 
 
359 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.66 
 
 
344 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.16 
 
 
343 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.82 
 
 
357 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.95 
 
 
388 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.03 
 
 
392 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.67 
 
 
388 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.56 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.54 
 
 
370 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.07 
 
 
367 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.99 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.68 
 
 
387 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.77 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.61 
 
 
386 aa  85.9  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.01 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.15 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.08 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  28.16 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.17 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  24.93 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.93 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  24.93 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  24.93 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.93 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.93 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.22 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.22 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
335 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.16 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
350 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.63 
 
 
358 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.26 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  24.93 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.11 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  25.26 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  23.69 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.11 
 
 
338 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  20.7 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
353 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>