192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2119 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  100 
 
 
330 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  78.79 
 
 
330 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  77.88 
 
 
330 aa  554  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  78.83 
 
 
338 aa  517  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  70.72 
 
 
332 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  66.98 
 
 
348 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  67.62 
 
 
328 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  66.67 
 
 
358 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  66.88 
 
 
338 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  66.15 
 
 
338 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  65.7 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  66.67 
 
 
327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  68.08 
 
 
327 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  68.08 
 
 
327 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  68.08 
 
 
327 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  68.08 
 
 
327 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  66.99 
 
 
327 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  66.99 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  66.99 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  67.87 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  66.99 
 
 
327 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  66.99 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  66.67 
 
 
327 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  66.34 
 
 
327 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  66.34 
 
 
327 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  66.67 
 
 
327 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  66.99 
 
 
327 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  59.75 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  56.35 
 
 
333 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  55.05 
 
 
342 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  57.19 
 
 
332 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  54.24 
 
 
334 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  52.74 
 
 
334 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  52.34 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  51.71 
 
 
334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  55.94 
 
 
326 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  54.98 
 
 
327 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  56.31 
 
 
327 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  55.99 
 
 
342 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  51.56 
 
 
335 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  44.84 
 
 
338 aa  294  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  36.6 
 
 
325 aa  208  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.66 
 
 
325 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  35.53 
 
 
336 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.67 
 
 
325 aa  192  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.42 
 
 
361 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.38 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.66 
 
 
367 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.7 
 
 
353 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.57 
 
 
386 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.45 
 
 
392 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.71 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.18 
 
 
340 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.78 
 
 
357 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.91 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.94 
 
 
344 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.4 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.32 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.21 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.41 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.18 
 
 
370 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.71 
 
 
388 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.16 
 
 
431 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28 
 
 
388 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.8 
 
 
355 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.68 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.03 
 
 
338 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.63 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.17 
 
 
383 aa  86.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.5 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.59 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.19 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  26.51 
 
 
362 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.4 
 
 
362 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  29.57 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.77 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.29 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.4 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.4 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.4 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.6 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.54 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.96 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  22.86 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1875  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.32 
 
 
363 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217985  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  30.32 
 
 
362 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
350 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
350 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.44 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2099  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.603993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>