193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0623 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  100 
 
 
327 aa  674    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  85.99 
 
 
327 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  79.2 
 
 
338 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  78.29 
 
 
338 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  77.46 
 
 
327 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  77.46 
 
 
327 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  73.33 
 
 
348 aa  524  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  77.14 
 
 
327 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  77.46 
 
 
327 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  77.46 
 
 
327 aa  524  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  73.33 
 
 
358 aa  524  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  77.46 
 
 
327 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  76.15 
 
 
327 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  77.78 
 
 
327 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  77.78 
 
 
327 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  75.87 
 
 
328 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  77.14 
 
 
327 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  77.67 
 
 
327 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  77.67 
 
 
327 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  77.67 
 
 
327 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  77.35 
 
 
327 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  77.02 
 
 
327 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  64.35 
 
 
330 aa  454  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  60.68 
 
 
330 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  60.75 
 
 
332 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  62.62 
 
 
338 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  59.13 
 
 
330 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  57.65 
 
 
333 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  57.46 
 
 
332 aa  381  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  55.17 
 
 
342 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  54.46 
 
 
337 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  56.62 
 
 
334 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  57.83 
 
 
334 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  57.19 
 
 
334 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  53.68 
 
 
335 aa  351  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  55.48 
 
 
326 aa  346  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  50.15 
 
 
334 aa  345  8e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  54.84 
 
 
342 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  54.84 
 
 
327 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  53.21 
 
 
327 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  48.06 
 
 
338 aa  296  4e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  32.83 
 
 
336 aa  199  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.19 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.86 
 
 
325 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.41 
 
 
325 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  34.04 
 
 
361 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.19 
 
 
360 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.85 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.66 
 
 
363 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.26 
 
 
367 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.7 
 
 
343 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.62 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.86 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.79 
 
 
431 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.06 
 
 
357 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.38 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.45 
 
 
367 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.39 
 
 
388 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.33 
 
 
359 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.38 
 
 
351 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.53 
 
 
344 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.85 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.35 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.62 
 
 
386 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.27 
 
 
370 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.81 
 
 
387 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.71 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.17 
 
 
383 aa  92.8  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.33 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  23 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.53 
 
 
338 aa  79  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.18 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.11 
 
 
362 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.48 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.17 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.17 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.17 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  26.02 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.17 
 
 
363 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  25.16 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.11 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  25.39 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.37 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.11 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  25.39 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
365 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
365 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.18 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
372 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.63 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.63 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>