77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1933 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  100 
 
 		 388 aa  783    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  63.57 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  57.27 
 
 		 387 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  49.75 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  53.1 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  39.52 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  29.32 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.92 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.82 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  30.48 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.06 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  29.23 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  30.25 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  28.92 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  28.66 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.87 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  28.35 
 
 		 358 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  26.73 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  27.69 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  28.66 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.05 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  27.94 
 
 		 330 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  28.04 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  28.04 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  28.04 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  27.73 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  28.04 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  27.73 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  28 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.82 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  27.22 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  33.33 
 
 		 326 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  27.5 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  27.73 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  27.3 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  26.85 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.45 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  26.54 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  28.93 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  26.54 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  26.38 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  26.54 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  26.54 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  29.67 
 
 		 335 aa  96.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  28.16 
 
 		 334 aa  96.3  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  30.28 
 
 		 327 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.52 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  25.08 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  26.4 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  29.3 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.97 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  29.3 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.71 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  25.51 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.11 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.94 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.14 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.68 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.36 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.98 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  25 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.6 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.43 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.86 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.48 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.4 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.98 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.7 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.46 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.51 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  26.24 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>