180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0745 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
130 aa  262  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  54.4 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  46.88 
 
 
141 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  46.4 
 
 
134 aa  123  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  45.97 
 
 
135 aa  120  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  43.09 
 
 
129 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  43.09 
 
 
138 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  43.2 
 
 
136 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  42.28 
 
 
151 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  43.85 
 
 
130 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  41.13 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  40.77 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  40.65 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  40.65 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  38.1 
 
 
169 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  35.25 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  40.65 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  39.02 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  38.71 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  38.21 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  38.21 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  38.21 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  38.21 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  38.21 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  38.21 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  37.9 
 
 
219 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  38.02 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  36.36 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  41.3 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  30.89 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  36.8 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  33.86 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  30.95 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  35.43 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  34.09 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  30.08 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  34.09 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  40.59 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  33.33 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  33.6 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  36.92 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  34.34 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  30.95 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  37.37 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  39.22 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  34.69 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  30.89 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  32.52 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  32.8 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  33.07 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  29.03 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  30.16 
 
 
156 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  29.03 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.78 
 
 
322 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.78 
 
 
322 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  38.83 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  32.54 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.78 
 
 
322 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  31.2 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  31.78 
 
 
322 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.78 
 
 
322 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  43.55 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  35.29 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  34.35 
 
 
179 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  26.15 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  33.33 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  33.33 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  33.04 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  36.54 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>