202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0873 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  96.95 
 
 		 131 aa  249  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  65.65 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  63.85 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  62.31 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  56.15 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  52.31 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  42.11 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  48.54 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  39.69 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  40.15 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  42.42 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  42.31 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  49.51 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  45.11 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  47.12 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  45.11 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  47.12 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  49.51 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  47.12 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  37.88 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 		 172 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  46.6 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  38.93 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  40.91 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  46.6 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  46.6 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  46.6 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  45.45 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  43.81 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  45.19 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  40.15 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  45.45 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  43.27 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  44.44 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  41.75 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  40.78 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  40.78 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  42.42 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  39.81 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  35.71 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  35.85 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  38.18 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.16 
 
 		 326 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  32.65 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  37.74 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  30.43 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  30.15 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  35.92 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  38.83 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  29.1 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  33.33 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  32.26 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  39.42 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  33.98 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  32.46 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  34.29 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  37.5 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  37.86 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  31.73 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.43 
 
 		 329 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  39.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  41.56 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  30 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  38.38 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  32.26 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  33.91 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  29.9 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  30.89 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>