192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4082 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  55.91 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  54.26 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  48.82 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  46.83 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  44.96 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  46.03 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  46.34 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  43.09 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  41.46 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  47.71 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  47.71 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  37.1 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  37.1 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  41.46 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  39.68 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  39.68 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  39.68 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  39.68 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  40.48 
 
 		 219 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  40.48 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  41.27 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  42.97 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  40.65 
 
 		 186 aa  90.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  38.89 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  39.68 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  39.68 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  37.9 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  38.89 
 
 		 175 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  42.28 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  36.07 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  40.48 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  40.38 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  37.1 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  41.9 
 
 		 165 aa  84.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  37.1 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  36.22 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  41.41 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  37.1 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  40.16 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  40.32 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  34.4 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  40.5 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  34.15 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  34.68 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  35.54 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  34.4 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  37.9 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  38.4 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  34.68 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  37.9 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  35.48 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  35.48 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  35.48 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  35.48 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  38.4 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  42.15 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  36 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  34.11 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  37.19 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  39.81 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  37.19 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  33.08 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  33.08 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  34.68 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  33.88 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  30.83 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  35.85 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  35.48 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  32.54 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  32.54 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  37.38 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  40.19 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  39.62 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  32.26 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  39.62 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  34.88 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  31.2 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  32.82 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  33.6 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  35.11 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>