152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0237 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  74.15 
 
 		 147 aa  227  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  70.55 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  65.99 
 
 		 150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  65.75 
 
 		 150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  62.25 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  62.76 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  62.76 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  55.13 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  57.72 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  52.32 
 
 		 169 aa  140  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  49.01 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  50.33 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  48.34 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  50.33 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  50.33 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  45.8 
 
 		 219 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  45.8 
 
 		 172 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  45.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  45.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  45.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  45.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  45.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  45.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  44.14 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  45.8 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  45.04 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  44.27 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  44.27 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  45.04 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  44.27 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  44.27 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  45.04 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  44.27 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  37.3 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  41.27 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  37.04 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  35.25 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  37.01 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  36.92 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  35.43 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  36.43 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  34.15 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  34.15 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  34.43 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  33.81 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  30.89 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  33.33 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  33.08 
 
 		 329 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  29.52 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  32.41 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  33.64 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.5 
 
 		 326 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  31.5 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  31.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  30.84 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  33.64 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  28.69 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  29.52 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  25.47 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  30.56 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  29.27 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  28.68 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  28.04 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  31.82 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  31.82 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  30.48 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  31.82 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  29.27 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  28.7 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  28.15 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  29.52 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  28.23 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  27.48 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  29.52 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.17 
 
 		 331 aa  50.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  25.71 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.08 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  29.52 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  39.44 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  27.88 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  26.92 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  26.56 
 
 		 330 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  32.11 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  27.78 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  30.51 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  27.05 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  27.78 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  30.53 
 
 		 324 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>