129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0323 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  100 
 
 		 156 aa  313  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  56.41 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  57.05 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  52.56 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  55.13 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  52.94 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  54.25 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  52.94 
 
 		 149 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  54.55 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  50.99 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  49.07 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  47.47 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  46.15 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  47.47 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  48.45 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  42.68 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  44.78 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  44.78 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  44.03 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  39.86 
 
 		 219 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  42.07 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  39.86 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  39.86 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  39.86 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  39.86 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  39.86 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  39.86 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  41.04 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  38.4 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  34.85 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  34.11 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  33.57 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  34.27 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  32.26 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  33.59 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  30.16 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  39.22 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  37.25 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  34.65 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  36 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  30.83 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  47.14 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  30.83 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  30.22 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  29.09 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  29.09 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.93 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  30.1 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  31.21 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  31.13 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.47 
 
 		 329 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  41.94 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  27.18 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  32.59 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  27.45 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  29.13 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  32.38 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  28.16 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  30.71 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  30.71 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  28.16 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  34 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  25.93 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  27.45 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  28.43 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  29.37 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  27.18 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  27.18 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  31.48 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  28.44 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  41.46 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  30.77 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  25.17 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.4 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  29.41 
 
 		 326 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  33.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  35.42 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  31.13 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  38.71 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  29.7 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>