162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3864 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3277  PTS system fructose IIA component  46.56 
 
 
142 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3997  PTS system fructose IIA component  45.04 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3979  PTS system fructose IIA component  45.04 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4102  PTS system fructose IIA component  45.04 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4051  PTS system fructose-specific transporter subunit IIA  45.04 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0648289 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4165  PTS system fructose transporter subunit IIA  45.04 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.315728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.37 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  32.31 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  27.97 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  28.87 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  28.1 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  31.4 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  27.21 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.57 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  27.35 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.2 
 
 
322 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  27.55 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  32.63 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  27.87 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  31 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  29.1 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  30.33 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  28.89 
 
 
322 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  28.87 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  27.37 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  24.58 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  29.84 
 
 
332 aa  57.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  30.33 
 
 
141 aa  57.8  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  26.6 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  29.47 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  29.47 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.15 
 
 
313 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  26.53 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  25.95 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  25.37 
 
 
330 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.61 
 
 
326 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  28.57 
 
 
326 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.87 
 
 
329 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.4 
 
 
318 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  24.58 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  28.57 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  31 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  27.19 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  27.19 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  28.28 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  27.2 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  29.47 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  25.81 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.42 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  26.45 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25 
 
 
331 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  26.05 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  27.37 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  27.55 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  31.37 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  29.03 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  28.42 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  28.35 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  26.09 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  26.32 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  23.93 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  27.55 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  25.98 
 
 
324 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.98 
 
 
324 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  25 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  27.37 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  25.6 
 
 
320 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.56 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  23.88 
 
 
336 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  28.42 
 
 
133 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5497  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  26.89 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.98 
 
 
324 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  28.42 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  27.37 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  28.42 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3255  PTS system fructose subfamily IIA component  27.13 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.622131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  27.37 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  27.37 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  32.58 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  25.86 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  26.53 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  27.37 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  24.79 
 
 
175 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.8 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>