206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1287 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
130 aa  256  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  77.69 
 
 
130 aa  206  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  72.31 
 
 
131 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  60.77 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  63.85 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  63.85 
 
 
131 aa  159  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  54.62 
 
 
130 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  46.21 
 
 
133 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  46.97 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  48.89 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  48.89 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  48.89 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  48.87 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  48.87 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  43.51 
 
 
133 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  46.92 
 
 
163 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  46.15 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  42.42 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 
172 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  48.41 
 
 
133 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  45.38 
 
 
133 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
152 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
135 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 
133 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 
133 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 
138 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  43.08 
 
 
133 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  42.75 
 
 
135 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  45.38 
 
 
133 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
133 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  43.08 
 
 
145 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  45.38 
 
 
133 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  44.36 
 
 
133 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  45.8 
 
 
136 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 
136 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
135 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  44.78 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  40.46 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  39.69 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  41.98 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  35.48 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  34.13 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  40.8 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  40 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  40.65 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.33 
 
 
331 aa  77.8  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  40.65 
 
 
134 aa  76.6  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  39.84 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  36.29 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  36.29 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  36.29 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  36.29 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  36.29 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  34.15 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  39.06 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  31.34 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  37.62 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.34 
 
 
326 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  34.68 
 
 
324 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  35.43 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  33.87 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  32.69 
 
 
329 aa  71.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  33.87 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  34.68 
 
 
323 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  34.09 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  32.26 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  27.2 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  33.06 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  31.97 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  41.67 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.08 
 
 
332 aa  67.8  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.45 
 
 
323 aa  67  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  27.64 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  32.52 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  30.89 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  27.97 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  31.2 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.65 
 
 
322 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  27.19 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>