170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0260 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  84.83 
 
 		 186 aa  248  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  84.14 
 
 		 175 aa  246  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  82.58 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  82.58 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  82.58 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  82.58 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  82.58 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  82.58 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  82.58 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  82.58 
 
 		 219 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  74.31 
 
 		 156 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  72.92 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  72.92 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  72.92 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  72.22 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  71.53 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  71.53 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  60 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  59.33 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  58 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  57.33 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  57.33 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  44.14 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  47.66 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  47.66 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  45.74 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  41.96 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  43.26 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  47.14 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  45.74 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  44.03 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  44.2 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  42.15 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  40.54 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 		 130 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  42.15 
 
 		 131 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  40.32 
 
 		 136 aa  94  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  41.46 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  38.3 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  36.43 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  37.78 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  39.01 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  34.15 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  38.02 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  36.22 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  35.58 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  36 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  37.19 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  31.2 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  31.2 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  34.71 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  35.51 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  32.8 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  31.5 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  33.85 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  33.06 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  33.58 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  32.08 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  34.34 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  32.08 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  32.38 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  36.45 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  32.38 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  32.54 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  32.54 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.87 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  31.15 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  33.59 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  30.33 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  30.33 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  30.91 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  32.38 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  32.54 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  30.19 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  32.38 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  30.19 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  28.85 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>