170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4186 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  92.05 
 
 		 175 aa  318  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  84.83 
 
 		 165 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  75.82 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  75.82 
 
 		 219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  75.33 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  75.33 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  75.33 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  75.33 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  75.33 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  75.33 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  72 
 
 		 156 aa  210  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  72 
 
 		 156 aa  210  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  72 
 
 		 156 aa  210  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  71.33 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  71.33 
 
 		 156 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  71.52 
 
 		 156 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  71.52 
 
 		 156 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  65.35 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  62.31 
 
 		 151 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  63.78 
 
 		 151 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  62.99 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  62.99 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  44.37 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  47.66 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  45.04 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  47.66 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  45 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  45.04 
 
 		 147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  44.83 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  44.78 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  43.41 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  46.09 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 		 130 aa  98.6  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  40.5 
 
 		 141 aa  97.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  37.31 
 
 		 140 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  40.71 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  41.13 
 
 		 136 aa  92.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  40.65 
 
 		 129 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  38.52 
 
 		 140 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  40.16 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  37.8 
 
 		 138 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  34.11 
 
 		 129 aa  87.4  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  34.68 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  37.01 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  37.04 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  36.52 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  38.02 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  31.71 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  31.71 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  30.4 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  37.31 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  31.01 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  35.51 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  34.71 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  32.79 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  39.42 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  31.06 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  39.42 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  29.23 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  33.93 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  31.3 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  31.15 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  29.08 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  31.15 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  31.15 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  31.31 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  30.53 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  33.06 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  30.77 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  30.53 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 		 133 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  34.29 
 
 		 142 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  29.81 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  31.73 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  34.34 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  29.37 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  29.37 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  38.68 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  30.47 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.84 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  31.58 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  32.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  26.24 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  29.37 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  29.25 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>