147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02221 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  100 
 
 		 130 aa  256  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0752  sugar transport protein  81.54 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0666  PTS system fructose subfamily IIA component  81.54 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0949  PTS system fructose subfamily IIA component  83.85 
 
 		 130 aa  202  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  40.16 
 
 		 131 aa  95.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  42.06 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  38.76 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  40.5 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  36.29 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  38.21 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  39.02 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  33.07 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  36.89 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  37.4 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  38.1 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  36.7 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  33.88 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  37.61 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  34.71 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  34.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  34.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  34.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  34.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  34.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  34.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  36.36 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  34.71 
 
 		 219 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  34.71 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  33.64 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  34.34 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  34.92 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  32.67 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  35.35 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  35.35 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  32.54 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  35.25 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  30.4 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  30.58 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  30.61 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  31.75 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  34.65 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 		 179 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  34.13 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  32.56 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  34.13 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  33.94 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  31.31 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  43.55 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  35.11 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  30.95 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  29.6 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  34.86 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  31.48 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  28.8 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  32.32 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  31.2 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  26.53 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  30.69 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  35.19 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  32.65 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  35.29 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  25.62 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  30.95 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  32.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  33.02 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  33.02 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  32.17 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  29.69 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  29.69 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  36.67 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.32 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  35 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  41.07 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  28.28 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  45.1 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  28.28 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  42.59 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>