197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0218 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  55.81 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  48.82 
 
 
129 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  44.96 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  51.18 
 
 
169 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  42.74 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  48.03 
 
 
151 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  47.24 
 
 
151 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  44.62 
 
 
186 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  40.32 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  36.84 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  43.85 
 
 
165 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  44.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  44.09 
 
 
219 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  50.39 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  50.39 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  44.62 
 
 
175 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0295  PTS system fructose subfamily IIA component  42.74 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182968 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  44.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  44.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  44.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  44.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  44.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  41.46 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  41.13 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  41.98 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  42.52 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  42.97 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0290  PTS system fructose subfamily IIA component  41.94 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  42.52 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1280  PTS system fructose subfamily IIA component  42.4 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  42.52 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  41.73 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  42.19 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  41.09 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  40.8 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  38.52 
 
 
134 aa  84.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  37.01 
 
 
147 aa  84.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0297  PTS system fructose subfamily IIA component  37.01 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  37.8 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  35.43 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  35.34 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  33.62 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  36.89 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  37.6 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  39.25 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  37.04 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  36.07 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  38.32 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  38.32 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.4 
 
 
322 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  34.35 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02221  sugar transport protein  36.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.201475  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  38.32 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  35.51 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  33.6 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  38.32 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.58 
 
 
331 aa  75.5  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  33.6 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  33.6 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  32.28 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  36.07 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  38.52 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  37.14 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  34.13 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  37.14 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  38.32 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  32.58 
 
 
326 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  33.6 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  32.79 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  36.19 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  40.91 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  33.6 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  36.19 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  34.13 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.82 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  33.6 
 
 
323 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  36.59 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  36.19 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  31.97 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  37.04 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  37.04 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  33.6 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>