209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2848 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  75.94 
 
 
133 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  74.44 
 
 
133 aa  200  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  75.19 
 
 
133 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  75.19 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  74.44 
 
 
133 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  75.19 
 
 
133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  74.44 
 
 
133 aa  197  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  75.19 
 
 
163 aa  197  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  75.94 
 
 
133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  73.68 
 
 
133 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  72.93 
 
 
133 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  72.18 
 
 
133 aa  194  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  72.18 
 
 
133 aa  193  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  72.18 
 
 
133 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  72.18 
 
 
133 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  73.68 
 
 
133 aa  191  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  73.68 
 
 
133 aa  191  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  73.68 
 
 
133 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  67.42 
 
 
135 aa  191  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  67.18 
 
 
134 aa  184  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  65.41 
 
 
133 aa  183  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  66.92 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  67.67 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  66.17 
 
 
133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  67.16 
 
 
135 aa  181  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
134 aa  167  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
142 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  56.82 
 
 
135 aa  158  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  63.85 
 
 
135 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 
140 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  55.81 
 
 
165 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  51.61 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  74.39 
 
 
82 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  49.19 
 
 
132 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  49.19 
 
 
132 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  48.39 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  50 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  51.61 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  46.56 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  50.81 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  38.35 
 
 
138 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  45.8 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  45.8 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  44.03 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  44.27 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  43.08 
 
 
130 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 
145 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
131 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  44.36 
 
 
136 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  41.54 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  39.39 
 
 
133 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  38.76 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  40.6 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  35.61 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  36.59 
 
 
130 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  43.27 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  36.89 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  33.33 
 
 
322 aa  74.3  0.0000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  34.69 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  31.97 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  30.4 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  30.4 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  33.6 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  33.33 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  36.52 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  33.33 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  32.5 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.93 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  38.26 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  32.08 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.42 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  32.08 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  33.33 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  33.06 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  32.23 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  31.97 
 
 
320 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.4 
 
 
318 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  33.67 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  31.45 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  33.61 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.15 
 
 
324 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  30.33 
 
 
324 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  30.33 
 
 
324 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>