208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1501 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
145 aa  289  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  69.93 
 
 
147 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  70.29 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  69.85 
 
 
152 aa  186  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  56.3 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  51.15 
 
 
136 aa  137  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  40.91 
 
 
133 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  44.44 
 
 
139 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  40.74 
 
 
138 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
130 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  44.62 
 
 
130 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 
133 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  38.58 
 
 
141 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  40.91 
 
 
133 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  43.08 
 
 
130 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  40.91 
 
 
133 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  40.44 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  40.44 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  40.15 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  39.86 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  39.26 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  38.76 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  40.15 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
131 aa  97.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  37.98 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  40.31 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  40.91 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  40.15 
 
 
133 aa  95.9  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  40.15 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  39.71 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  38.76 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  38.81 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  38.81 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  38.81 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  39.55 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 
133 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 
133 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  36.43 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
133 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
163 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  31.45 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  33.88 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  34.15 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.85 
 
 
331 aa  81.3  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  33.06 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  32.8 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  35.77 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  31.11 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  36.36 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  36.15 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  37.8 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  37.01 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  35.25 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  37.19 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  36.22 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.25 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  35.77 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  30.89 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  37.8 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  33.01 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  37.01 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  35.66 
 
 
219 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  35.66 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  35.25 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  47.62 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  35.66 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  35.66 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  35.66 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  35.66 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  35.66 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  35.66 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  38.4 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.15 
 
 
326 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  37.6 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  37.6 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  33.82 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  29.73 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  36.27 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.38 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>