207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0146 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
136 aa  271  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  52.27 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  51.15 
 
 
145 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  54.48 
 
 
136 aa  135  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  50.76 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  49.62 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  42.42 
 
 
131 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  39.85 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  38.35 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  38.35 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
133 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  41.54 
 
 
130 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  37.69 
 
 
140 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  42.72 
 
 
135 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 
135 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  38.35 
 
 
133 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  38.35 
 
 
133 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 
133 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
147 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 
130 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  42.99 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  40.15 
 
 
131 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  40.15 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  36.09 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  36.84 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  36.84 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  36.84 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  35.38 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  37.1 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  36.84 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  36.09 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  42.59 
 
 
138 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  37.4 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  39.81 
 
 
138 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  39.81 
 
 
138 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  36.43 
 
 
165 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  39.85 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 
130 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  38.89 
 
 
138 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  34.68 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  35.45 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  35.92 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  35.92 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  35.16 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  37.3 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  37.6 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  33.86 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  33.62 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  35.43 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  32.33 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  33.33 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  36.61 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  31.71 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  33.64 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  34.65 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  30.95 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.55 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  37.12 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  43.9 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.57 
 
 
326 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.85 
 
 
331 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.48 
 
 
332 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  31.97 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  28.57 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  35.05 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  35.05 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  35.05 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  35.92 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  28.87 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  31.5 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  31.43 
 
 
329 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  36.19 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  35.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  35.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  35.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  35.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  35.29 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  29.08 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  28.46 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  30.17 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>