212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0252 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  87.97 
 
 		 133 aa  240  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  77.44 
 
 		 133 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  77.44 
 
 		 133 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  76.69 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  76.69 
 
 		 133 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  75.94 
 
 		 133 aa  204  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  72.73 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  75.19 
 
 		 133 aa  200  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  70.68 
 
 		 133 aa  197  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  69.17 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  69.17 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  72.18 
 
 		 133 aa  193  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  67.67 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  67.67 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  66.17 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  66.17 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  67.67 
 
 		 133 aa  183  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  66.17 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  66.17 
 
 		 133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  66.17 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  66.17 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  66.17 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  64.66 
 
 		 133 aa  180  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  61.83 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  62.69 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  62.31 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  57.58 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  63.85 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  52.71 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  51.22 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  50.41 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  50.41 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  69.62 
 
 		 82 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  49.59 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  42.75 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  49.59 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  44.62 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  45.8 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  51.22 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  43.28 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  43.61 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  43.28 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  40.91 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  40.31 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  36.84 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  43.51 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  48.78 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  42.11 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  36.09 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  37.69 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  37.9 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  34.09 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  34.4 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  31.58 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  36.29 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  31.15 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.61 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  36.29 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  36.29 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  34.13 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  37.04 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  34.13 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  35.65 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  33.04 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  34.43 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  31.71 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  35.34 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  35.65 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  31.62 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  35.19 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  33.65 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.86 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  35.71 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  29.37 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  30.33 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  30.33 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  34.31 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  30.33 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  30.33 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  34.13 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  35.51 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>