112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0769 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 384 aa  759    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  29.33 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  26.57 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  26 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  26.41 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  25.41 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  21.84 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  23.68 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.9 
 
 		 842 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.02 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  22.7 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  25.88 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.94 
 
 		 849 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  26.37 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.37 
 
 		 850 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  21.41 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.19 
 
 		 850 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.01 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.94 
 
 		 851 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  25.19 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.94 
 
 		 844 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  25.68 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  24.1 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  24.4 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  20.47 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  26.8 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  26.11 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  27.27 
 
 		 783 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  29.95 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0028  PepSY-associated TM helix  26.51 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522005  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  26.92 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.92 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.24 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  24.02 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  21.55 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.33 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.71 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  24.58 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  23.02 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.39 
 
 		 844 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.01 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  26.24 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  26.04 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  22.22 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.85 
 
 		 843 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  24.17 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  29.95 
 
 		 504 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.4 
 
 		 464 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  29.19 
 
 		 483 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.1 
 
 		 850 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.25 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  29.44 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  24.51 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  22.77 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.96 
 
 		 840 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.04 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  21.81 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  30.41 
 
 		 822 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  23.7 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  28.79 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  24.77 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  28.36 
 
 		 491 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.69 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.39 
 
 		 459 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.7 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.27 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.17 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.31 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  29.56 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  24.9 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.53 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  25.52 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  29.76 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.2 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  25.36 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  21.99 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  33.04 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  20.21 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.53 
 
 		 465 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  25.83 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.11 
 
 		 464 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  29.39 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  23.42 
 
 		 457 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  28.85 
 
 		 756 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.61 
 
 		 740 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.48 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  27.84 
 
 		 736 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  26.62 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  21.72 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  23.68 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  22.54 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  20.18 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>