117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2949 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  27.75 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  23.1 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.46 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  24.79 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.17 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  27.47 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  26.06 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.8 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  25 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.86 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.47 
 
 		 842 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  25.94 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  27.4 
 
 		 844 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  28.85 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  28.85 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.48 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  22.91 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.42 
 
 		 843 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.99 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.86 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  25.75 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  25.19 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  24.32 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  29.34 
 
 		 756 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  29.61 
 
 		 530 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  27.07 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  27.98 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  21.78 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  28.24 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.09 
 
 		 840 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.57 
 
 		 840 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.16 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.59 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.39 
 
 		 850 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  27.59 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  33.97 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.34 
 
 		 456 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  20.72 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  25.19 
 
 		 455 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  27.71 
 
 		 783 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.17 
 
 		 849 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  22.31 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  24.58 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  24.18 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  27.42 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.91 
 
 		 735 aa  53.1  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  28.5 
 
 		 371 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.73 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  29.15 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.95 
 
 		 851 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  23.24 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.7 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.46 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  24.93 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  27.23 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  25.51 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  24.24 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  27.6 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.55 
 
 		 740 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1810  PepSY-associated TM helix family protein  23.94 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.3 
 
 		 844 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  27.78 
 
 		 472 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  31.55 
 
 		 479 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.93 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  24.12 
 
 		 484 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.93 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.93 
 
 		 739 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.93 
 
 		 739 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.07 
 
 		 850 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.96 
 
 		 410 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.38 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  26.73 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.25 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  29.65 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  24.68 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.99 
 
 		 728 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  20.75 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  23.64 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  25.25 
 
 		 470 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 465 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  24.62 
 
 		 479 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  22.09 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  23.68 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  23.12 
 
 		 487 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.33 
 
 		 512 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  26.98 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1117 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  24.78 
 
 		 822 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  29.3 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  21.21 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  22.61 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.63 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.92 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.46 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  23.38 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  28.12 
 
 		 782 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>