205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6301  major facilitator transporter  100 
 
 		 519 aa  975    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  56.19 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  31.15 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.24 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  42.39 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 385 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 396 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  44.38 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 377 aa  94  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 383 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  37.64 
 
 		 432 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  40.2 
 
 		 403 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  35.9 
 
 		 383 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  43.71 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  43.71 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 392 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 378 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  36.53 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  42.41 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  36.16 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  45.16 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  32.1 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  32.1 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  32.1 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  32.1 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  35.15 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  32.1 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  34.29 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  35.8 
 
 		 414 aa  80.1  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.98 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  37.43 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.24 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.24 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  33.89 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  38.86 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  32.47 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  36.81 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>