More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0141 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  76.02 
 
 
193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  45.3 
 
 
182 aa  176  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
198 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
202 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 
192 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 
192 aa  147  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
201 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
202 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  46.36 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
203 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
202 aa  144  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 
210 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
204 aa  141  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
193 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0307  peptidyl-tRNA hydrolase  44.23 
 
 
194 aa  141  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 
209 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
184 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 
225 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
235 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 
197 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  48.12 
 
 
207 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  45.1 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  42.04 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  47.79 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
186 aa  134  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
193 aa  134  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  44.6 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  42.48 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
201 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 
216 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 
211 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 
211 aa  130  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  43.05 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
192 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
192 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
192 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  39.64 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  44.23 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  37.99 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.25 
 
 
199 aa  125  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
189 aa  124  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  42.76 
 
 
190 aa  124  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 
204 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
187 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  35.91 
 
 
203 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  40.79 
 
 
185 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.23 
 
 
206 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
217 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.13 
 
 
188 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 
230 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  44.87 
 
 
181 aa  121  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  36.59 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  36.52 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  34.21 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  34.9 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  40.28 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  44.87 
 
 
199 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 
205 aa  119  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  36.94 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.72 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  42.36 
 
 
210 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  34.07 
 
 
189 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.13 
 
 
195 aa  117  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  43.14 
 
 
189 aa  117  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  44.37 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  40.97 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  44.37 
 
 
248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  43.07 
 
 
181 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  33.91 
 
 
190 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  33.91 
 
 
190 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.41 
 
 
192 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.8 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.8 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.8 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  35.59 
 
 
210 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  39.35 
 
 
193 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  43.07 
 
 
181 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  39.39 
 
 
201 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  35.59 
 
 
207 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>