More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0912 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  61.46 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  60.21 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  60.73 
 
 		 195 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  60 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  60.82 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  58.42 
 
 		 196 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  56.54 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.1 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.1 
 
 		 196 aa  207  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  61.9 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  53.4 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  60.73 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  55.39 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  56.32 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  59.07 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  55.96 
 
 		 199 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  55.9 
 
 		 192 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  59.8 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  53.33 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  54.74 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  57.14 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  56.02 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  52.33 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  57.81 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  56.99 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  52.33 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  55.49 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  46.6 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  46.56 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  47.12 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  44.78 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  46.33 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 194 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 192 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  37.85 
 
 		 179 aa  135  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  35.79 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.98 
 
 		 187 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 193 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  32.45 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  39.55 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.79 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.27 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.81 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  35.75 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  35.75 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  34.62 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  36.65 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  41.86 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  41.9 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  33.16 
 
 		 186 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  34.74 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.39 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>