More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0656 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  83.42 
 
 		 199 aa  353  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  45.64 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  44.1 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  38.14 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.28 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 217 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.54 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.2 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.59 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.78 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  38.78 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.4 
 
 		 198 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  43.15 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.65 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.24 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  39.5 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  35.64 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.76 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  39.7 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  40.3 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  36.27 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4503  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 		 217 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  41.42 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  43.07 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  46.76 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.38 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  35.6 
 
 		 189 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  43.84 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.29 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  37.24 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>