More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03510 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  62.24 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  63.5 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  62.76 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  58.88 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  64.82 
 
 		 195 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  56.78 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  57.73 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  56.41 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  63.45 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  56.25 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  58.33 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  59.3 
 
 		 196 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  57.95 
 
 		 194 aa  204  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  55.44 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  55.9 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  53.81 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  52.33 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  56.06 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  57.58 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  56.85 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  49.23 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  59.16 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  49.23 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  53.5 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  49.23 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  56.28 
 
 		 195 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  52.26 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  49.23 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  51.26 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  57.73 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  52.08 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  47.18 
 
 		 192 aa  167  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  48.72 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.15 
 
 		 199 aa  160  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  44.56 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  47.64 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 185 aa  152  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.64 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  41.54 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  44.16 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  45.99 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 		 192 aa  138  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.44 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.94 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  36.46 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.23 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  37.85 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 186 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 225 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.19 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.6 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  36.9 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  34.55 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  48.21 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  44.05 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  43.83 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  34.22 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  36.67 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  36.67 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.46 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  39.75 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>