More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2675 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  65.59 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  57.53 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  56.76 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 188 aa  224  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  52.66 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  54.35 
 
 		 188 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  52.72 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  52.72 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  51.89 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 217 aa  156  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 195 aa  151  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 193 aa  148  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  40.33 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 207 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  39.33 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1451  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.810799  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  38.65 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>