More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3160 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  65.59 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  57.53 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  55.14 
 
 		 188 aa  220  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  53.26 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  53.51 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  52.17 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  54.89 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  55.14 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  48.65 
 
 		 193 aa  185  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 194 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 193 aa  144  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 189 aa  140  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 191 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 206 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  43.83 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  43.21 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  42.61 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0817  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00002095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  41.46 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  41.46 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 		 228 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>