More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0048 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
186 aa  390  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  78.92 
 
 
186 aa  321  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
207 aa  277  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
210 aa  277  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
207 aa  276  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
207 aa  276  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
186 aa  276  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
186 aa  276  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
207 aa  276  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
186 aa  276  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
207 aa  276  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  68.28 
 
 
186 aa  275  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  69.19 
 
 
186 aa  273  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 
190 aa  204  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 
191 aa  204  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 
190 aa  201  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 
190 aa  201  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
187 aa  201  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 
188 aa  194  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 
191 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 
188 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  54.91 
 
 
189 aa  187  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 
188 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 
196 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
188 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 
183 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 
213 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  54.6 
 
 
185 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 
217 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  46.88 
 
 
191 aa  181  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
210 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 
202 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  48.63 
 
 
186 aa  178  4e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 
202 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
202 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.85 
 
 
206 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
202 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 
193 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 
214 aa  175  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
186 aa  174  6e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 
189 aa  174  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 
181 aa  174  9e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 
190 aa  174  9e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  47.73 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  46.56 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
186 aa  170  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  44.2 
 
 
201 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 
219 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
213 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
206 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  47.54 
 
 
196 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  44.94 
 
 
205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 
208 aa  165  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  45.79 
 
 
189 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  45.13 
 
 
209 aa  164  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 
189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 
186 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.47 
 
 
205 aa  160  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  46.51 
 
 
205 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 
180 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
210 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
187 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
189 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
192 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 
209 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  46.99 
 
 
198 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  45.34 
 
 
193 aa  157  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  49.08 
 
 
190 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
185 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 
199 aa  155  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 
186 aa  155  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 
204 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 
217 aa  154  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  43.58 
 
 
365 aa  154  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 
239 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 
188 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 
188 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  44.31 
 
 
206 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
185 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  43.53 
 
 
193 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  46.06 
 
 
235 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  43.79 
 
 
196 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 
201 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 
206 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
190 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>