More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1128 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  71.66 
 
 
188 aa  271  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  60.89 
 
 
219 aa  268  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  56.45 
 
 
188 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  56.52 
 
 
185 aa  210  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  53.26 
 
 
186 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  52.72 
 
 
193 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  54.89 
 
 
186 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  52.72 
 
 
186 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  50.81 
 
 
191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 
194 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
184 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 
209 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
188 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
196 aa  142  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 
193 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 
187 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
192 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
189 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
186 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
196 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
195 aa  138  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
186 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 
187 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
217 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 
186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  36.6 
 
 
196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 
186 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
201 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 
213 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 
214 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
207 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
183 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
191 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.69 
 
 
199 aa  126  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  35.42 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 
206 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
201 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
190 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  33.51 
 
 
197 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
188 aa  122  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 
213 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
189 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 
189 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
228 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  47.5 
 
 
181 aa  121  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  33.92 
 
 
195 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  44.58 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 
185 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  34.78 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  44.1 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  35.38 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
190 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  44.31 
 
 
181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  36.7 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  37.29 
 
 
193 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 
199 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  38.12 
 
 
189 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  44.31 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>