More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2760 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  70.27 
 
 
185 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  70.97 
 
 
190 aa  275  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  48.91 
 
 
209 aa  171  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.37 
 
 
201 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  42.46 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 
197 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
191 aa  158  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 
195 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  47.12 
 
 
217 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  51.89 
 
 
191 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.49 
 
 
213 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
186 aa  152  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 
196 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  45.86 
 
 
192 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
186 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
187 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
183 aa  148  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
189 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
196 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
189 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 
192 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.64 
 
 
198 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
193 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  48.03 
 
 
211 aa  141  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 
204 aa  141  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  48.03 
 
 
211 aa  141  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 
195 aa  141  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
194 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 
213 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
184 aa  140  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 
207 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
188 aa  140  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  48.98 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 
186 aa  139  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  47.02 
 
 
192 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  43.58 
 
 
225 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
189 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  35.52 
 
 
189 aa  138  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
207 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
193 aa  137  7e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  47.64 
 
 
202 aa  137  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.59 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
186 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
186 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  36.51 
 
 
191 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
206 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 
201 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
194 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 
194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.58 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 
210 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  43.41 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  44.6 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  44.83 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  42.95 
 
 
182 aa  132  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  51.95 
 
 
194 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  46.3 
 
 
232 aa  131  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  44.65 
 
 
201 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  33.7 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  43.27 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  34.05 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  33.51 
 
 
188 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  50.33 
 
 
205 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  43.27 
 
 
225 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  40.46 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>