More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0676 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
213 aa  440  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  57.37 
 
 
191 aa  231  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  57.29 
 
 
192 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  57.45 
 
 
211 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  57.45 
 
 
211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 
232 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  56.91 
 
 
210 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 
207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  53.65 
 
 
225 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 
230 aa  214  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 
213 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3732  peptidyl-tRNA hydrolase  57.73 
 
 
192 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 
216 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3629  peptidyl-tRNA hydrolase  56.76 
 
 
226 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 
187 aa  201  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  52.41 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0340  peptidyl-tRNA hydrolase  56.06 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0287  peptidyl-tRNA hydrolase  54.36 
 
 
198 aa  194  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854961  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  50.25 
 
 
201 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  50.25 
 
 
201 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  56.38 
 
 
193 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 
192 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0389  peptidyl-tRNA hydrolase  55.38 
 
 
202 aa  191  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0179253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  52.38 
 
 
194 aa  191  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0275  peptidyl-tRNA hydrolase  54.82 
 
 
200 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613029  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0294  peptidyl-tRNA hydrolase  47.64 
 
 
193 aa  188  5e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0248  peptidyl-tRNA hydrolase  54.31 
 
 
200 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0942  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 
194 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
194 aa  187  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1102  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 
194 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
194 aa  187  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  51.05 
 
 
192 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  51.05 
 
 
192 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0720  peptidyl-tRNA hydrolase  53.65 
 
 
194 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0754  peptidyl-tRNA hydrolase  53.65 
 
 
194 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0764  peptidyl-tRNA hydrolase  53.12 
 
 
194 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3606  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 
194 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00295121  normal  0.0514505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4463  peptidyl-tRNA hydrolase  53.12 
 
 
194 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 
193 aa  184  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0393  peptidyl-tRNA hydrolase  55.05 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41540  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 
194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4135  peptidyl-tRNA hydrolase  49.75 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0987  peptidyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 
194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0071  peptidyl-tRNA hydrolase  50.8 
 
 
187 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3134  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 
208 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000686708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4755  peptidyl-tRNA hydrolase  53.65 
 
 
194 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215279  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  49.24 
 
 
200 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258134  normal  0.0303401 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2042  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 
187 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1984  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0267905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0347  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 
203 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1500  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 
201 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2928  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 
201 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0751  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 
201 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5322  peptidyl-tRNA hydrolase  52.08 
 
 
194 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 
201 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0567  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 
201 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00595812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1053  peptidyl-tRNA hydrolase  51.04 
 
 
196 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0313  peptidyl-tRNA hydrolase  49.75 
 
 
200 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163585  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  48.62 
 
 
193 aa  175  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0472  peptidyl-tRNA hydrolase  49.24 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3258  peptidyl-tRNA hydrolase  54.74 
 
 
197 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2190  peptidyl-tRNA hydrolase  48.73 
 
 
199 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2804  peptidyl-tRNA hydrolase  48.73 
 
 
199 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6134  peptidyl-tRNA hydrolase  48.73 
 
 
199 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.014975  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2815  peptidyl-tRNA hydrolase  48.73 
 
 
199 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490887  normal  0.867617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0511  peptidyl-tRNA hydrolase  49.24 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2864  peptidyl-tRNA hydrolase  48.22 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00616861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2722  peptidyl-tRNA hydrolase  48.22 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.016718  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2344  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  48.9 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0504  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 
194 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61790  peptidyl-tRNA hydrolase  51.04 
 
 
194 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0172217  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0785  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 
196 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000418835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2920  peptidyl-tRNA hydrolase  48.17 
 
 
195 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374558  normal  0.0910923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1007  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
195 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149931  normal  0.240982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1072  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
195 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0876072  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1184  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
195 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0909  aminoacyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 
197 aa  168  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2064  peptidyl-tRNA hydrolase  53.68 
 
 
195 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2367  aminoacyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 
196 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2074  peptidyl-tRNA hydrolase  53.16 
 
 
196 aa  167  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01179  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2443  Aminoacyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0491513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  normal  0.097849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1309  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1351  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1685  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  0.435145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01189  hypothetical protein  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2422  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
194 aa  167  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0426078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1922  peptidyl-tRNA hydrolase  49.22 
 
 
196 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004208  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 
196 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1850  peptidyl-tRNA hydrolase  53.68 
 
 
195 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1011  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
195 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00579564  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2572  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102375  normal  0.060871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1761  peptidyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 
196 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000319671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3258  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2853  peptidyl-tRNA hydrolase  49.48 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000370002  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3300  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>