More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0529 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  60.11 
 
 		 192 aa  232  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  59.68 
 
 		 193 aa  229  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  56.38 
 
 		 213 aa  216  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 		 211 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0987  peptidyl-tRNA hydrolase  62.37 
 
 		 194 aa  211  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  53.44 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  56.99 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0347  peptidyl-tRNA hydrolase  59.68 
 
 		 203 aa  205  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 201 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 201 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0285  peptidyl-tRNA hydrolase  56.54 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  50.8 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 		 191 aa  201  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 		 194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0248  peptidyl-tRNA hydrolase  55.33 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0275  peptidyl-tRNA hydrolase  55.33 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 192 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  56.12 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258134  normal  0.0303401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0393  peptidyl-tRNA hydrolase  53.69 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4135  peptidyl-tRNA hydrolase  56.12 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 193 aa  191  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  52.41 
 
 		 192 aa  191  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2722  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.016718  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0472  peptidyl-tRNA hydrolase  55.61 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2864  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00616861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0511  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6134  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.014975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2815  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490887  normal  0.867617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2190  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2804  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0071  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0751  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2042  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0567  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00595812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1500  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2928  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0313  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0340  peptidyl-tRNA hydrolase  53.85 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  48.89 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5322  peptidyl-tRNA hydrolase  56.08 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3606  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00295121  normal  0.0514505 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  47.78 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1102  peptidyl-tRNA hydrolase  55.03 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0287  peptidyl-tRNA hydrolase  53.33 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0942  peptidyl-tRNA hydrolase  55.56 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41540  peptidyl-tRNA hydrolase  53.44 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0720  peptidyl-tRNA hydrolase  53.97 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3732  peptidyl-tRNA hydrolase  54.12 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0754  peptidyl-tRNA hydrolase  53.97 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61790  peptidyl-tRNA hydrolase  55.03 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0172217  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4463  peptidyl-tRNA hydrolase  53.44 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0764  peptidyl-tRNA hydrolase  53.44 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1761  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000319671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1053  peptidyl-tRNA hydrolase  54.5 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3629  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2578  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 189 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3559  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0389  peptidyl-tRNA hydrolase  52.33 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0179253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2706  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 235 aa  175  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004208  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 		 196 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1984  peptidyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 		 196 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0267905 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0504  peptidyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01245  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3134  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000686708  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1627  peptidyl-tRNA hydrolase  51.55 
 
 		 196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.660591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3258  peptidyl-tRNA hydrolase  53.44 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1804  peptidyl-tRNA hydrolase  52.43 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2146  peptidyl-tRNA hydrolase  52.43 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1522  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0197498  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1922  peptidyl-tRNA hydrolase  51.03 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3468  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000174641  normal  0.19866 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0294  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4755  peptidyl-tRNA hydrolase  52.38 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215279  normal  0.389314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01179  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2443  Aminoacyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0491513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2344  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01189  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1351  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1309  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2422  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0426078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1685  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  0.435145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  normal  0.097849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 225 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2367  aminoacyl-tRNA hydrolase  53.97 
 
 		 196 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 225 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3693  peptidyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 		 194 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000643435  normal  0.128415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>