More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0824 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 225 aa  453  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  99.56 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  89.33 
 
 		 225 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  68.09 
 
 		 235 aa  318  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  69.04 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  65.32 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  67.93 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  61.24 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  61.24 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  61.9 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  64.17 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  61.9 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  57.98 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  59.81 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 189 aa  235  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  62.77 
 
 		 203 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  64.36 
 
 		 203 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  58.51 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  58.25 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  56.91 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  57.67 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  60.64 
 
 		 201 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  56.91 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  57.45 
 
 		 207 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  56.38 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  55.34 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 202 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 189 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  59.14 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  54.26 
 
 		 196 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  57.75 
 
 		 243 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  53.71 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  53.71 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  53.62 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  54.35 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  55.38 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  54.27 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  53.27 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  47.51 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  54.36 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  51.45 
 
 		 188 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  50.87 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  45.86 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  46.41 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  51.01 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 193 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.18 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  49.32 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 		 188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  51.74 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  46.91 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  44.33 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  33.81 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0212  peptidyl-tRNA hydrolase  48.86 
 
 		 191 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.145584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  51.33 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 192 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 195 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.99 
 
 		 191 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  41.11 
 
 		 190 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  49.68 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  43.93 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0285  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  44 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  46.51 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.87 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  46.51 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  46.51 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 193 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  47.44 
 
 		 194 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 193 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  50.29 
 
 		 193 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  41.44 
 
 		 194 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.52 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.52 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.52 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.59 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.94 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.94 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.35 
 
 		 185 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40.94 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.64 
 
 		 189 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>