More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1768 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  77.95 
 
 		 207 aa  331  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  79.38 
 
 		 207 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  76.29 
 
 		 206 aa  323  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  75.62 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  76.88 
 
 		 204 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  76.53 
 
 		 202 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  68.23 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  68.23 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  68.23 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  65 
 
 		 202 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  68.25 
 
 		 205 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  65.46 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  67.53 
 
 		 203 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  63.54 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  58.16 
 
 		 198 aa  244  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  59.79 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  60.54 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  60.11 
 
 		 225 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  61.17 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  60.64 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  61.29 
 
 		 192 aa  224  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  58.46 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 192 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  54.74 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  56.92 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  56.99 
 
 		 251 aa  217  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  57.75 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  60.54 
 
 		 248 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 		 189 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  48.96 
 
 		 193 aa  211  7.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  54.45 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  60.61 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  59.46 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  52.88 
 
 		 234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  53.55 
 
 		 243 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 		 182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  48.63 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  45.18 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.76 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  46.94 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.13 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  40.99 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.13 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  37.58 
 
 		 365 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  49.68 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  44.77 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  44.77 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 		 216 aa  131  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  47.74 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  49.67 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  43.86 
 
 		 205 aa  131  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.72 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  49.04 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  40.35 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  48.7 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  47.26 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  48.05 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  46.51 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>