More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3680 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  78.01 
 
 		 193 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  76.44 
 
 		 194 aa  285  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  73.94 
 
 		 188 aa  276  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  73.4 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  64.4 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  58.64 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.68 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  53.89 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  55.15 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  51.74 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  51.74 
 
 		 225 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  50.58 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  47.16 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  49.14 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  44.69 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.82 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.78 
 
 		 219 aa  154  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  45.93 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  48.88 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  43.35 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  43.93 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  45.4 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  48.03 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  48.67 
 
 		 210 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  45.2 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  42.41 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 365 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>