More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0417 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  67.04 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  64.65 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  64.8 
 
 		 197 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  63.84 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  64.86 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  64.8 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  61.8 
 
 		 196 aa  227  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  62.3 
 
 		 198 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  61.88 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  60 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  61.83 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  59.89 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  56.83 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  63.84 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  59.56 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  59.56 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  57.14 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  61.54 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  61.67 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  53.85 
 
 		 192 aa  194  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  57.53 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  61.11 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  54.4 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  54.4 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  54.4 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  61.11 
 
 		 191 aa  191  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  56.25 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  60.62 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  57.63 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  47.78 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  59.36 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  52.75 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  48.04 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  52.51 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  54.35 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  44.94 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  50.66 
 
 		 202 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.2 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  50.56 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  47.49 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  50.63 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  44.69 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 		 184 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  50.63 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 		 188 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.46 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  49.37 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.12 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  48.88 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.19 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  47.8 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 189 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  43.58 
 
 		 196 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  48.31 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  48.31 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  49.35 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  44.69 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  44.13 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  47.17 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  47.17 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  39.33 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.34 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  45.4 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  45.78 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  47.19 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  48.1 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.88 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  43.18 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  49.68 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  44.13 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>