More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0778 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  83.42 
 
 		 199 aa  353  1e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  44.56 
 
 		 209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  41.41 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 188 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.81 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  41.45 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  42.56 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.39 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  38.34 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  36.98 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  43 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  41.11 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  44.93 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 189 aa  134  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.6 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  39.55 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  45.4 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 		 217 aa  130  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  36.65 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  48.53 
 
 		 182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>