More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0227 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  62.19 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  58.29 
 
 		 213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  59.49 
 
 		 209 aa  248  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  57.87 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  56.06 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  57.44 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  57.44 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  52.53 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  49.25 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.6 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  48.42 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  42.79 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  42.79 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.79 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 		 189 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 188 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  44.78 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 186 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  43.3 
 
 		 180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  45.79 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  37.22 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 188 aa  151  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 199 aa  151  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.55 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.45 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.35 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.4 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  45.08 
 
 		 193 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  42.35 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  38.12 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 188 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  37.31 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>