More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03281 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  98.51 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  51.49 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  48.74 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  49.5 
 
 		 205 aa  228  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  52.82 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  43.65 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.79 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  45.13 
 
 		 209 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  43.59 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  52.47 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.85 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.49 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.89 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  44.89 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.59 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 189 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  38.07 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 365 aa  148  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 193 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  44.1 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 190 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  44.33 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 		 183 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 		 184 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  44.65 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.13 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  45.06 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  36.6 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  38.66 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  36.6 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.11 
 
 		 191 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  35.71 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  34.9 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  36.73 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  33.85 
 
 		 232 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  35.57 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 		 239 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  43.83 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0785  peptidyl-tRNA hydrolase  37.81 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000418835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 		 190 aa  131  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1761  peptidyl-tRNA hydrolase  37.81 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000319671  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  43.59 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  35.05 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  38 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004208  peptidyl-tRNA hydrolase  37.31 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  34.33 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3606  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00295121  normal  0.0514505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  32.46 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  41.25 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>