More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2056 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.6 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  46.41 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  47.45 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 		 189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  46.56 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 186 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 190 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.13 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 193 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 		 186 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 187 aa  155  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 192 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.13 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  41.44 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  40.4 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 189 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.19 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 186 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.4 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 196 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.7 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  36.1 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 198 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 		 186 aa  141  9e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  38.62 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.33 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  38.64 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  38.64 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 		 184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  46.37 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 194 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.83 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.32 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.6 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  44.85 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  36.57 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  36.17 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>