More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2414 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  53.26 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  48.42 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.99 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  48.96 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  47.54 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 188 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 208 aa  157  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1451  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.810799  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 199 aa  151  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 		 213 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.58 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 196 aa  148  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.45 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.35 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>