More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2121 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  45.71 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 209 aa  158  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  44.87 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.45 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  45.18 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.05 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 232 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  43.64 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  47.2 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  38 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0389  peptidyl-tRNA hydrolase  45.12 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0179253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 		 204 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>