More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1292 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 		 198 aa  241  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  60.21 
 
 		 195 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  59.38 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  58.33 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  62.23 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  61.14 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.64 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  59.89 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  57.51 
 
 		 194 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  53.4 
 
 		 217 aa  205  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  57.81 
 
 		 196 aa  204  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  58.59 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  60.73 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  57.36 
 
 		 199 aa  201  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  52.6 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  52.6 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  52.6 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  56.57 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  56.19 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  55 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  56.77 
 
 		 191 aa  185  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  52.6 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  54.08 
 
 		 194 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.32 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 188 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.41 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  45.74 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  43.98 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  43.98 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 193 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0285  peptidyl-tRNA hydrolase  45.23 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  51.57 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0987  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.54 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.29 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 191 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 		 192 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 185 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.14 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  47.93 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  47.93 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>