More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0663 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  43.88 
 
 
201 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  43.65 
 
 
201 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
213 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.4 
 
 
214 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
194 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 
188 aa  141  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
192 aa  138  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 
213 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
209 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
202 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
192 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 
195 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.11 
 
 
206 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  37.36 
 
 
192 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  37.36 
 
 
192 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  37.36 
 
 
192 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  37.76 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 
202 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.81 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  35.11 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  43.9 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 
210 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 
210 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 
210 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
211 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
211 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.6 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  33.7 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  34.74 
 
 
202 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.74 
 
 
202 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
207 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 
196 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
191 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
192 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 
198 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  34.95 
 
 
193 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
192 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  35.52 
 
 
189 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  32.97 
 
 
187 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 
214 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 
189 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 
191 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
188 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
207 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
191 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
191 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 
198 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  37.42 
 
 
188 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.14 
 
 
186 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
207 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
207 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
207 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
210 aa  121  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
188 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 
206 aa  121  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  38.51 
 
 
216 aa  121  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 
189 aa  120  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  32.79 
 
 
186 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.59 
 
 
193 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
184 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  34.2 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  32.98 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  32.79 
 
 
207 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 
186 aa  119  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 
187 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  34.78 
 
 
190 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
196 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 
196 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  40.94 
 
 
201 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
194 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  32.61 
 
 
186 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 
213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  32.98 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  34.04 
 
 
193 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  32.64 
 
 
199 aa  118  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
190 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>