More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2474 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  97.62 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  88.83 
 
 		 202 aa  360  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  80.1 
 
 		 203 aa  314  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  79.08 
 
 		 203 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  68.23 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  64.85 
 
 		 202 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 204 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  67.91 
 
 		 196 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  66.15 
 
 		 202 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  63.05 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  64.06 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  64.58 
 
 		 207 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  65.1 
 
 		 207 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  62.83 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  63.3 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 		 205 aa  241  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  64.17 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  65.24 
 
 		 225 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  64.71 
 
 		 225 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  50.47 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  57.45 
 
 		 189 aa  218  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  59.68 
 
 		 192 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  60.64 
 
 		 248 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  64.24 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  56.76 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  58.03 
 
 		 251 aa  207  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  56.46 
 
 		 239 aa  207  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  54.63 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  54.63 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  48.19 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  54.4 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  56.28 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  52.08 
 
 		 192 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  54.21 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  58.47 
 
 		 243 aa  197  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  53.97 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  52.38 
 
 		 189 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  47.46 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  46.33 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  50.34 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.17 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  48.55 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  52.7 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  47.98 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  47.98 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  48.65 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  44.13 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 192 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.64 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  48.12 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.53 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.71 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 365 aa  138  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.81 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  35 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.16 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 191 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  51.43 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  51.43 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4503  peptidyl-tRNA hydrolase  43.14 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>