More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1944 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  67.03 
 
 
209 aa  256  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  64.13 
 
 
201 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  64.17 
 
 
197 aa  242  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  62.03 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  61.8 
 
 
213 aa  227  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  58.73 
 
 
189 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 
206 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  55.03 
 
 
198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  60.82 
 
 
195 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  54.74 
 
 
192 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  61.5 
 
 
195 aa  204  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 
199 aa  201  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  57.65 
 
 
199 aa  199  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  56.45 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 
192 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 
192 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 
192 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  56.61 
 
 
196 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  55.05 
 
 
202 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
217 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  56.61 
 
 
196 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 
194 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  54.26 
 
 
196 aa  184  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  53.89 
 
 
194 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  53.37 
 
 
198 aa  178  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  52.66 
 
 
191 aa  175  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  53.81 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 
191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  54.46 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
217 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 
188 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  52.2 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
199 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 
188 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  47.22 
 
 
185 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 
193 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 
206 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 
185 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  50.77 
 
 
204 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.65 
 
 
205 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
201 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
202 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 
194 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 
192 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 
195 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
192 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
192 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  45.61 
 
 
196 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 
191 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  40.33 
 
 
186 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 
187 aa  142  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
206 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
225 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 
207 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 
186 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 
202 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  49.35 
 
 
198 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 
207 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 
202 aa  140  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 
210 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.99 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 
235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  46.32 
 
 
193 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 
207 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  49.32 
 
 
190 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
207 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 
210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 
210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
186 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
186 aa  138  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
186 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
196 aa  138  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
186 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
213 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
182 aa  137  7e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  45.29 
 
 
192 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 
179 aa  137  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 
204 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
207 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  40.85 
 
 
189 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  42.41 
 
 
201 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>