More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3210 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  62.63 
 
 		 192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 192 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  64.36 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  64.71 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  62.3 
 
 		 197 aa  224  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  61.46 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  61.58 
 
 		 191 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  56.54 
 
 		 209 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  60.82 
 
 		 195 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  54.08 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  54.17 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  57.63 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  57.98 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  57.73 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  55.49 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  57.79 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  57.89 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  58.03 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  58.25 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  57.37 
 
 		 196 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  55.96 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  58.29 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  54.46 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  53.5 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  58.82 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  54.15 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  54 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.33 
 
 		 188 aa  168  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  48.59 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.74 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  55.15 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  52.75 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  51.08 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  51.08 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  47.02 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.93 
 
 		 186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  46.37 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  36.7 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  51.95 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.1 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.88 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.28 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.1 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.1 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  38.82 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.1 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  46.89 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  37.85 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 220 aa  144  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  41.84 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 		 190 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 		 190 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  47.43 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  46.86 
 
 		 225 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  46.29 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  48.73 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>