More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0537 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  88.42 
 
 
190 aa  357  8e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  56.45 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
210 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  54.3 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 
186 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 
186 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  45.99 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  45.5 
 
 
191 aa  175  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
185 aa  174  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  46.6 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
188 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
188 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
188 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
186 aa  167  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
183 aa  167  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
188 aa  167  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
191 aa  167  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 
189 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
187 aa  164  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
185 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  48.75 
 
 
189 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 
365 aa  157  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
189 aa  157  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  44.05 
 
 
186 aa  157  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  46.56 
 
 
181 aa  155  3e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
186 aa  155  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 
206 aa  154  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
184 aa  154  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 
189 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
189 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 
186 aa  152  2e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
196 aa  150  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  43.45 
 
 
186 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
214 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 
189 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  43.82 
 
 
205 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
190 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
213 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 
186 aa  147  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  41.38 
 
 
217 aa  147  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 
195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  43.26 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
191 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 
190 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
189 aa  144  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.35 
 
 
202 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 
202 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 
194 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
206 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.35 
 
 
202 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
202 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
187 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
193 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
213 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
201 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
210 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
192 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.6 
 
 
205 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
181 aa  141  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 
195 aa  141  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.64 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 
201 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
180 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  36.02 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  36.99 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  41.95 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 
225 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
200 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  37.71 
 
 
204 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
192 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
192 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  36.99 
 
 
239 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
192 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>